Фауна ГНПП «Бурабай» в 2023 году насчитывает 381 видов. Из этого числа 16 видов птиц (лебедь-кликун, белоглазая чернеть, турпан, могильник, степной орёл, орёл-карлик, беркут, скопа, серый журавль и другие) и 1 вид млекопитающих -лесная куница занесены в Красную книгу Казахстана, а 21 вид занесены в Международный список охраны природы (МСОП).
На территории ГНПП «Бурабай» установлены фотоловушки, которые незаменимы для контроля за популяцией, изучением и наблюдениями за жизнью редких видов, в условиях дикой природы. Камеры закрепляют в местах кормления, на водопоях, солонцах или путях миграции. В результате получают снимки, не нарушая естественного образа жизни животных, птиц.
Наиболее частыми объектами фотосессий являются олени, косули, лоси, из пернатых кряква. Всего же за всё время работы фотоловушек в парке камеры зафиксировали более десятка видов млекопитающих, в том числе представителей редких или исчезающих видов фауны.
В июне 2020 года фотоловушкой на террритории Боровского лесничества сделаны уникальные документальные съемки орла – карлика. Птица занесена в Красную книгу Казахстана, потому что орел-карлик единственный представитель политипического рода в фауне Казахстана. В 2021 году было впервые зафиксировано изображение рыси, а летом 2022 года на камеру попался краснокнижный серый журавль.
Благодаря природоохранной деятельности работников лесничеств, в целом, фауна Нацпарка увеличивается. Государственные испекторы готовят кормушки для зимовья, оберегают от браконьеров, пожаров.
Кроме асканийских оленей, возрасла численность косуль, лосей, маралов. К слову, в 2008 году было 1074 голов косуль, а в 2022 году достигло 1485 голов. За 10 лет в 4 раза увеличилось поголовье одного из крупных видов парнокопытных животных – лосей. Сохраняя природу мы сохраним и их обитателей.